یونیورسٹی آف بارسلونا کے ماہرین، انسٹی ٹیوٹ فار ایڈوانسڈ کیمسٹری آف کاتالونیا (IQAC-CSIC)، انسٹی ٹیوٹ آف مائیکرو الیکٹرانکس آف بارسلونا (IMB-CNM-CSIC) اور آراگون نانو سائنس اینڈ میٹریلز انسٹی ٹیوٹ آف آراگون (INMA) — ایک مشترکہ انسٹی ٹیوٹ CSIC اور یونیورسٹی آف زراگوزا — نے ٹرپلیکس بنانے والی پروب ٹیکنالوجی کی بنیاد پر آر این اے وائرس کا پتہ لگانے کے لیے ایک نیا طریقہ تیار کیا ہے۔ یہ اختراعی طریقہ کار SARS-CoV-2، انفلوئنزا اے وائرس (H1N1) یا سانس لینے والی سنسیٹیئل وائرس (RSV) جیسے وائرسوں کا پتہ لگانے کے لیے نئے آپشنز کھولتا ہے، یہ ایک روگجن ہے جو نوزائیدہ بچوں کو متاثر کرتا ہے اور اس کے لیے محتاط تفریق کی ضرورت ہوتی ہے۔
یہ بین الضابطہ مطالعہ، میں شائع ہوا۔ بین الاقوامی جرنل آف مالیکیولر سائنسز، کی قیادت کارلوس جے. سیوڈاڈ اور ویرونیکا نو کر رہے ہیں، فیکلٹی آف فارمیسی اینڈ فوڈ سائنسز اور یونیورسٹی آف بارسلونا کے انسٹی ٹیوٹ آف نینو سائنس اینڈ نینو ٹیکنالوجی (IN2UB) سے؛ Ramón Eritja, Anna Aviñó, Lluïsa Vilaplana اور M. Pilar Marco, IQAC-CSIC اور CIBER آف Bioengineering, Biomaterials and Nanomedicine (CIBER-BBN) سے؛ Manuel Gutiérrez، Antoni Baldi اور César Fernández، IMB-CNM-CSIC سے، اور Valeria Grazu اور Jesús Martínez، CSIC کے محققین Institute of Nanoscience and Materials and Aragón INMA (CSIC-UNIZAR) اور CIBER-BBN۔
یہ مطالعہ PoC4CoV پروجیکٹ کے تناظر میں کیا گیا، جس کی قیادت ایم. پیلر مارکو اور سیزر فرنانڈیز کر رہے تھے اور CSIC کے گلوبل ہیلتھ پلیٹ فارم (PTI) کے ذریعے مالی اعانت فراہم کی گئی۔ تحقیقی مطالعہ COVID-19 کے خلاف لڑنے کے لیے La Marató de TV3 2020 کے ذریعے مالی اعانت فراہم کیے جانے والے پروجیکٹ کے حصے کے طور پر جاری ہے، جس میں UB کی فیکلٹی آف کیمسٹری کے ماہرین بھی شرکت کرتے ہیں۔
وائرل آر این اے کو پکڑنے کے لیے پولی پیورین ہیئر پین
نیا طریقہ کار پولی پیورین ہیئر پنز (PPRHs) کی صلاحیت پر مبنی ہے — جسے UB کے کینسر تھراپی گروپ نے ڈیزائن کیا ہے — تاکہ وائرل RNA کو پکڑا جا سکے اور ایک اعلیٰ وابستگی والا ٹرپلیکس بنایا جا سکے۔ جب اس ہائبرڈ ڈھانچے کو مالیکیولر پروب سے منسلک کیا جاتا ہے اور متاثرہ مریض کے نمونے کے ساتھ رابطے میں رکھا جاتا ہے تو وائرل ایجنٹ کا پتہ لگانے کا سگنل حاصل کیا جاتا ہے۔ سائنسی اشاعت میں پیش کردہ طریقہ کو Triplex Enhanced Nucleic Acid Detection Assay (TENADA) کہا جاتا ہے۔
\”PPRHs غیر ترمیم شدہ واحد پھنسے ہوئے DNA ہیئر پنز ہیں جو اینٹی متوازی پولی پیورین کے دو سپیکولر ڈومینز پر مشتمل ہیں۔ یہ ڈومینز، ایک دوسرے سے ایک تھامائڈائن لوپ کے ذریعے جڑے ہوئے ہیں، انٹرمولیکولر ریورس ہوگسٹین بانڈز کے ذریعے جڑے ہوئے ہیں۔ مالیکیولر ہیئر پین خاص طور پر واحد پولی پیورین کے برابر پولی پیورین سے منسلک ہو سکتے ہیں۔ -پھنسے ہوئے DNA (ssDNA)، ڈبل پھنسے ہوئے DNA (dsDNA) یا واٹسن-کرک بانڈز کے ذریعے RNA وائرس، اس طرح ایک متوازی ٹرپلیکس تشکیل دیتے ہیں،\” UB کے شعبہ حیاتیات اور فزیالوجی سے تعلق رکھنے والے پروفیسر کارلوس J. Ciudad کہتے ہیں۔
پی سی آر ٹیسٹ سے زیادہ موثر اور تیز طریقہ
وائرل RNA کی کھوج میں ایک فائدہ یہ ہے کہ PPRH طریقہ کار کو ریورس ٹرانسکرپٹیس کی مداخلت کے بغیر لاگو کیا جا سکتا ہے — وہ اینزائم جو RNA کو DNA میں تبدیل کرتا ہے — یا تھرمو سائکلر (وہ آلہ جو پولیمریز چین ری ایکشن کے ساتھ جینیاتی مواد کے نمونوں کو بڑھاتا ہے) یا پی سی آر)۔ اس کے علاوہ، اس کی حساسیت اور مخصوصیت PCR ٹیسٹ کے مساوی ہے اور یہ ایک گھنٹے سے بھی کم وقت میں نتائج فراہم کر سکتا ہے۔
مطالعہ کے حصے کے طور پر، ٹیم نے کئی بائیو ڈیٹیکشن آلات میں سینڈوچ ہائبرڈائزیشن کی حکمت عملی کا استعمال کیا۔ اس حکمت عملی میں دو oligonucleotides کا استعمال کیا گیا ہے: ایک ٹرپلیکس تشکیل دینے والا PPRH ہیئرپین ایک کیپچر پروب کے طور پر کام کرتا ہے اور ایک لیبل لگا ہوا ڈوپلیکس تشکیل دینے والا DNA oligonucleotide پتہ لگانے کی تحقیقات کے طور پر کام کرتا ہے۔
\”ٹرپلیکس بنانے والے PPRH ہیئر پنز کو SARS-CoV-2 پولی پائریمائیڈائن کی ترتیب سے منسلک کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا تھا، جبکہ پتہ لگانے کی تحقیقات کو پولی پائریمائڈائنز کے ہدف کی جگہ کے قریب والے علاقے کے لیے تکمیلی کے طور پر ڈیزائن کیا گیا تھا۔ اس طرح، SARS-CoV-2 کی موجودگی آر این اے کا پتہ بائیو سینسر کی سطح پر ٹرنری کمپلیکس کی تشکیل سے ہوتا ہے،\” پروفیسر ویرونیکا نو (UB-IN2UB) کہتی ہیں۔
اس طریقہ کار کو ایک کمپیکٹ الیکٹرو کیمیکل ڈیوائس میں لاگو کیا گیا ہے جو ایک چپ پر دو الیکٹروڈ الیکٹرو کیمیکل سیل کو ضم کرتا ہے — جو IMB-CNM-CSIC مائیکرو اور نانوفابریکیشن کلین روم میں تیار کیا جاتا ہے — اور کاغذ پر ایک فلوڈک جزو، اور تھرمل لیٹرل میں۔ نائٹرو سیلولوز اور پلازمونک نینو پارٹیکلز اور تھرمل پیپر کا استعمال کرتے ہوئے فلو سسٹم جو INMA (CSIC-UNIZAR) میں تیار کیا گیا ہے۔
ٹیناڈا: بائیو میڈیکل ریسرچ میں ایپلی کیشنز
PPRHs کو سائنسی ادب میں بنیادی طور پر کینسر میں ملوث متعدد جینوں کے جین کو خاموش کرنے کے اوزار کے طور پر بیان کیا گیا ہے۔ اس کے علاوہ، انہیں ڈی این اے میتھیلیشن کی حیثیت کا تعین کرنے اور فنگس کی وجہ سے نمونیا کی تشخیص کے لیے چھوٹے RNA مالیکیولز (miRNA) کی کھوج کے لیے بائیوسینسرز میں تحقیقات کے طور پر بھی شامل کیا گیا ہے۔ نیوموسسٹس جیروویسی۔
اب، TENADA کا نیا طریقہ کار نہ صرف وائرل ذرات کا پتہ لگانے میں کارگر ثابت ہوتا ہے۔ وائرل RNA کے لیے PPRHs کی اعلیٰ وابستگی ایک خاصیت ہے جسے وائرس کی نقل کے عمل کو روکنے کے لیے لاگو کیا جا سکتا ہے۔ اس وجہ سے، SARS-CoV-2 وائرس سے متاثرہ VeroE6 نسب کے خلیوں میں پولی پورائن ہیئرپین کلپس CC1PPRH اور CC2PPRH کی اینٹی وائرل خصوصیات کا بھی اب مطالعہ کیا جا رہا ہے۔
مزید برآں، اس میں شامل مختلف گروہوں کے ذریعہ کئے گئے کام بھی اس ٹیکنالوجی کی بنیاد رہے ہیں جسے جولائی 2022 میں UB پیٹنٹ سنٹر، CSIC اور CIBER-BBN کی شرکت کے ذریعے پیٹنٹ اور لائسنس دیا گیا تھا۔ اس کے علاوہ، یہ پیٹنٹ ٹیکنالوجی کے تحفظ اور کمپنی کے لائسنسنگ معاہدے کے عمل میں Bosch i Gimpera Foundation (FBG-UB) کے انتظام کے ذریعے ہسپانوی کمپنی Nanoinmunotech کو غیر خصوصی بنیادوں پر لائسنس دیا گیا ہے۔
>>Join our Facebook page From top right corner. <<